| Actinopterygii (Костистые рыбы) |
| Acipenseriformes (Осетрообразные) |
| Acipenseridae (Осетровые) |
| Acipenser baerii | Сибирский осетр | | 2 | Acipenser baerii |
| Salmoniformes (Лососеобразные) |
| Salmonidae (Лососевые) |
| Coregonus muksun | Муксун | Популяция бассейна р. Морды-Яха, полупроходная, озерная форма | 2 | Coregonus muksun |
| Hucho teimen | Таймень | | 1 | Hucho taimen |
| Coregonus tugun | Тугун | Популяция р. Собь | 2 | Coregonus tugun |
| Salvelinus alpinus | Арктический голец | Проходная форма, Байдарацкая губа | озерная форма, оз. Большое Щучье | 2 | 3 | Salvelinus alpinus |
| Scorpaeniformes (Скорпенообразные) |
| Cottidae (Керчаковые, рогатковые) |
| Coitus gobio | Обыкновенный подкаменщик | | 2 | Cottus gobio |
| Amphibia (Амфибии) |
| Anura (Бесхвостые) |
| Bufonidae (Жабы) |
| Bufo btitfo | Обыкновенная или серая жаба | | 3 | Bufo bufo |
| Ranidae (Лягушки) |
| Rana temporaria | Травяная лягушка | | 1 | Rana temporaria |
| Rana amurensis | Сибирская лягушка | | 3 | Rana amurensis |
| Caudata |
| Hynobiidae |
| Salamandrella keyserlingii | Сибирский углозуб | | 3 | Salamandrella keyserlingii |
| Aves (Птицы) |
| Anseriformes (Гусеобразные) |
| Anatidae (Утиные) |
| Rufibrenta ruficollis | Краснозобая казарка | | 3 | Branta ruficollis |
| Anas formosa | Клоктун | | 4 | Anas formosa |
| Anser erythropus | Пискулька | | 3 | Anser erythropus |
| Cygnus bewickii | Малый лебедь | | 2 | Cygnus columbianus bewickii |
| Charadriiformes (Ржанкообразные) |
| Haematopodidae (Кулики-сороки) |
| Haematopus ostralegus | Кулик-сорока | | 4 | Haematopus ostralegus |
| Charadriidae (Ржанковые) |
| Pluvialis squatarola | Тулес | Популяция в верховьях р. Пякупур | 4 | Pluvialis squatarola |
| Scolopacidae (Бекасовые) |
| Calidris alpina | Чернозобик | Популяция в верховьях р. Пякупур | 4 | Calidris alpina |
| Limicola falcinellus | Грязовик | Популяция в верховьях р. Пякупур | 4 | Limicola falcinellus |
| Stercorariidae (Поморниковые) |
| Stercorarius parasiticus | Короткохвостый поморник | Популяция в верховьях р. Пякупур | 4 | Stercorarius parasiticus |
| Falconiformes (Соколообразные) |
| Accipitridae (Ястребиные) |
| Aquila chrysaetos | Беркут | | 2 | Aquila chrysaetos |
| Haliaeetus albicilla | Орлан белохвост | | 3 | Haliaeetus albicilla |
| Pandion haliaetus | Скопа | | 2 | Pandion haliaetus |
| Falconidae (Соколиные) |
| Falco peregrinus peregrinus | Сапсан, обыкновенный подвид | | 1 | Falco peregrinus peregrinus |
| Falco rusticolus | Кречет | | 2 | Falco rusticolus |
| Falco peregrinus calidus | Сапсан, тундровый подвид | | 3 | Falco peregrinus calidus |
| Gaviiformes (Гагарообразные) |
| Gaviidae (Гагаровые) |
| Gavia adamsii | Белоклювая гагара | | 4 | Gavia adamsii |
| Gruiformes (Журавлеобразные) |
| Gruidae (Журавлиные) |
| Grus leucogeranus | Стерх | | 1 | Grus leucogeranus |
| Passeriformes (Воробьинообразные) |
| Laniidae (Сорокопутовые) |
| Lanius excubitor | Серый сорокопут | | 3 | Lanius excubitor |
| Strigiformes (Совообразные) |
| Strigidae (Настоящие совы) |
| Bubo bubo | Филин | | 2 | Bubo bubo |
| Mammalia (Млекопитающие) |
| Artiodactyla (Парнопалые) |
| Cervidae (Оленьи) |
| Rangifer tarandus tarandus | Тундровый олень | Ямало-Белоостровская популяция | Гыданская популяция | Полярно-Уральская популяция | 2 | 2 | 4 | Rangifer tarandus tarandus |
| Carnivora (Хищные) |
| Odobenidae (Моржовые) |
| Odobenus rosmarus rosmarus | Атлантический морж | | 1 | Odobenus rosmarus rosmarus |
| Felidae (Кошачьи) |
| Felis lynx | Рысь | | 3 | Lynx lynx |
| Mustelidae (Куньи) |
| Meles meles sibiricus | Сибирский барсук | | 4 | Meles meles sibiricus |
| Ursidae (Медвежьи) |
| Ursus maritimus | Белый медведь | | 3 | Ursus maritimus |
| Cetacea (Китообразные) |
| Monodontidae (Нарваловые) |
| Monodon monoceros | Нарвал | | 3 | Monodon monoceros |
| Balaenidae (Гладкие киты) |
| Balaena mysticetus | гренландский кит | Североатлантическая популяция | 1 | Balaena mysticetus |
| Balaenopteridae (Полосатиковые) |
| Balaenoptera physalus physalus | Северный финвал, или сельдяной кит | | 2 | Balaenoptera physalus physalus |
| Reptilia (Рептилии) |
| Squamata (Чешуйчатые) |
| Lacertidae (Настоящие ящерицы) |
| Lacerta vivipara | Живородящая ящерица | | 3 | Zootoca vivipara |
| Viperidae (Гадюковые) |
| Vipera berus | Обыкновенная гадюка | | 2 | Vipera berus |
Все ООПТ
