| Actinopterygii (Костистые рыбы) |
| Acipenseriformes (Осетрообразные) |
| Acipenseridae (Осетровые) |
| 32 | Acipenser ruthenus | Стерлядь | | 3 | Acipenser ruthenus |
| Salmoniformes (Лососеобразные) |
| Salmonidae (Лососевые) |
| 33 | Hucho taimen | Обыкновенный таймень | | 2 | Hucho taimen |
| 34 | Coregonus tugun | Тугун | | 3 | Coregonus tugun |
| 35 | Coregonus lavaretus sajanensis | Саянский озерный высокотелый сиг | | 3 | Coregonus lavaretus sajanensis |
| 36 | Thymallus arcticus dentatus | Зубастый сибирский озерный хариус | | 1 | Thymallus arcticus dentatus |
| 37 | Thymallus arcticus sajanensis | | | 2 | Thymallus arcticus sajanensis |
| Aves (Птицы) |
| Anseriformes (Гусеобразные) |
| Anatidae (Утиные) |
| 46 | Anser fabalis middendorfii | Таежный гуменник | | 3 | Anser fabalis middendorffii |
| 47 | Eulabeia indica | Горный гусь | | 2 | Anser indicus |
| 48 | Cygnopsis cygnoides | Сухонос | | 1 | Anser cygnoides |
| 49 | Cygnus cygnus | Лебедь-кликун | | 2 | Cygnus cygnus |
| 50 | Cygnus bewickii | Малый лебедь | | 3 | Cygnus columbianus bewickii |
| 51 | Tadorna tadorna | Пеганка | | 3 | Tadorna tadorna |
| 52 | Oxynra leucocephala | Савка | | 1 | Oxyura leucocephala |
| Apodiformes (Стрижеобразные) |
| Apodidae (Стрижи) |
| 89 | Hirundapus caudacutus | Иглохвостый стриж | | 3 | Hirundapus caudacutus |
| Charadriiformes (Ржанкообразные) |
| Laridae (Чайковые) |
| 85 | Laris ichthuaetus | Черноголовый хохотун | | 5 | Ichthyaetus ichthyaetus |
| 86 | Hidroprogne caspia | Чеграва | | 3 | Hydroprogne caspia |
| 87 | Sterna albifrons | Малая крачка | | 3 | Sternula albifrons |
| Charadriidae (Ржанковые) |
| 77 | Charadrius leschenaultii | Толстоклювый зуек | | 3 | Charadrius leschenaultii |
| 78 | Charadrius veredus | Восточный зуек | | 3 | Charadrius veredus |
| Recurvirostridae (Шилоклювковые) |
| 79 | Himantopus himantopus | Ходулочник | | 3 | Himantopus himantopus |
| 80 | Recurvirostra avosetta | Шилоклювка | | 3 | Recurvirostra avosetta |
| Scolopacidae (Бекасовые) |
| 81 | Gallinago solitaria | Горный дупель (бекас-отшельник) | | 3 | Gallinago solitaria |
| 82 | Numenius arquata | Большой кроншнеп | | 3 | Numenius arquata |
| 83 | Limosa limosa | Большой веретенник | | 3 | Limosa limosa |
| 84 | Limnodromus semipalmatus | Азиатский бекасовидный веретенник | | 4 | Limnodromus semipalmatus |
| Ciconiiformes (Аистообразные) |
| Ciconiidae (Аистовые) |
| 45 | Ciconia nigra | Черный аист | | 3 | Ciconia nigra |
| Ardeidae (Цаплевые) |
| 43 | Egretta flba | | | 3 | Egretta flba |
| Threskiornithidae (Ибисовые) |
| 44 | Platalea leucoroda | Колпица | | 2 | Platalea leucorodia |
| Falconiformes (Соколообразные) |
| Accipitridae (Ястребиные) |
| 53 | Pandion haliatus | Скопа | | 3 | Pandion haliaetus |
| 54 | Pernis ptilorhyneus | Хохлатый осоед | | 4 | Pernis ptilorhynchus |
| 55 | Circus macrourus | Степной лунь | | 2 | Circus macrourus |
| 56 | Aquila rapax | Степной орел | | 3 | Aquila rapax |
| 57 | Aguila clanga | Большой подорлик | | 3 | Aquila clanga |
| 58 | Aquila heliaca | Могильник | | 2 | Aquila heliaca |
| 59 | Aquila chrysaelos linnalus | Беркут | | 3 | Aquila chrysaetos |
| 60 | Haliaeetus leucoryphus | Орлан долгохвост | | 1 | Haliaeetus leucoryphus |
| 61 | Haliaeetus albicilla | Орлан белохвост | | 3 | Haliaeetus albicilla |
| 62 | Gypaetus barbatus | Бородач | | 1 | Gypaetus barbatus |
| 63 | Acypius monachus | Черный гриф | | 3 | Aegypius monachus |
| Falconidae (Соколиные) |
| 64 | Falco rusticolus | Кречет | | 1 | Falco rusticolus |
| 65 | Falco cherrug | Балобан | | 2 | Falco cherrug |
| 66 | Falco peregrinus | Сапсан | | 2 | Falco peregrinus |
| 67 | Falco naumanni | Степная пустельга | | 2 | Falco naumanni |
| Galliformes (Курообразные) |
| Phasianidae (Фазановые) |
| 68 | Tetraogallus altaicus | Алтайский улар | | 3 | Tetraogallus altaicus |
| 69 | Alectoris chukar dzungarica | Кеклик джунгарский | | 4 | Alectoris chukar dzungarica |
| 70 | Coturnix coturnix | Перепел | | 3 | Coturnix coturnix |
| Gruiformes (Журавлеобразные) |
| Gruidae (Журавлиные) |
| 71 | Grus grus lilfordi | Серый журавль | | 3 | Grus grus lilfordi |
| 72 | Grus monacha | Черный журавль | | 2 | Grus monacha |
| 73 | Anthropoides vigro | Журавль-красавка | | 3 | Anthropoides virgo |
| Otididae (Дрофиные) |
| 75 | Otis tarda | Дрофа | | 1 | Otis tarda |
| 76 | Chlamydotis undulata | Вихляй | | 1 | Chlamydotis undulata |
| Rallidae (Пастушковые) |
| 74 | Crex crex | Коростель | | 3 | Crex crex |
| Passeriformes (Воробьинообразные) |
| Alaudidae (Жаворонковые) |
| 90 | Melanocorypha mongolica | Монгольский жаворонок | | 3 | Melanocorypha mongolica |
| Muscicapidae (Мухоловковые) |
| 91 | Saxicola insignis | Большой чекан | | 1 | Saxicola insignis |
| Pelecaniformes (Пеликанообразные) |
| Pelecanidae (Пеликановые) |
| 42 | Pelecanus crispus | Кудрявый пеликан | | 2 | Pelecanus crispus |
| Strigiformes (Совообразные) |
| Strigidae (Настоящие совы) |
| 88 | Bubo bubo jenisseens | Филин | | 2 | Bubo bubo yenisseensis |
| Mammalia (Млекопитающие) |
| Artiodactyla (Парнопалые) |
| Bovidae |
| 111 | Procapra gutturosa | Дзерен | | 1 | Procapra gutturosa |
| 112 | Ovis ammon ammon | Алтайский горный баран | | 1 | Ovis ammon ammon |
| Cervidae (Оленьи) |
| 110 | Rangifer taranndus fennicus | Северный олень | | 3 | Rangifer tarandus fennicus |
| Carnivora (Хищные) |
| Canidae (Псовые) |
| 104 | Cuon alpinus | Красный волк | | 1 | Cuon alpinus |
| Felidae (Кошачьи) |
| 108 | Felis manul | Манул, палласов кот | | 5 | Felis manul |
| 109 | Uncia uncia | Ирбис, снежный барс | | 1 | Uncia uncia |
| Mustelidae (Куньи) |
| 105 | Vormela peregusna | Перевязка | | 3 | Vormela peregusna |
| 106 | Martes foina | Куница каменная | | 3 | Martes foina |
| 107 | Lutra lutra | Речная выдра | | 3 | Lutra lutra |
| Chiroptera (Рукокрылые) |
| Vespertilionidae (Гладконосые (обыкновенные) летучие мыши) |
| 92 | Myotis mystacinys | Усатая ночница | | 3 | Myotis mystacinus |
| 93 | Plecotus auritus | Бурый ушан | | 3 | Plecotus auritus |
| 94 | Vespertilio murinus | Кожан двухцветный | | 1 | Vespertilio murinus |
| Rodentia (Грызуны) |
| Castoridae (Бобровые) |
| 97 | Castor fiber tuvinicus | Бобр тувинский | | 1 | Castor fiber tuvinicus |
| Cricetidae (Хомяковые) |
| 98 | Allocriecetulus curtatus | Монгольский хомячок | | 4 | Allocricetulus curtatus |
| 99 | Phodopus roborovskii | Хомячок Роборовского | | 3 | Phodopus roborovskii |
| 100 | Alticola argentatus tuvinicus | Тувинская серебристая полевка | | 3 | Alticola argentatus tuvinicus |
| 101 | Alticola stoliczanus | Центрально-азиатская горная полевка | | 3 | Alticola stoliczanus |
| Dipodidae (Тушканчиковые) |
| 95 | Dipus sagitta | Тушканчик мохноногий | | 4 | Dipus sagitta |
| 96 | Cardiocranius paradoxus | Тушканчик карликовый пятипалый | | 2 | Cardiocranius paradoxus |
| Sciuridae (Беличьи) |
| 102 | Marmota sibirica | Сурок-тарбаган | | 3 | Marmota sibirica |
| 103 | Marmota baibacina | Сурок серый | | 2 | Marmota baibacina |
| Reptilia (Рептилии) |
| Squamata (Чешуйчатые) |
| Colubridae (Ужовые) |
| 40 | Natrix natrix | Обыкновенный уж | | 1 | Natrix natrix |
| Lacertidae (Настоящие ящерицы) |
| 38 | Fremias multiocellata | Ящурка глазчатая | | 3 | Eremias multiocellata |
| 39 | Fremias przevalskii tuvinsis | Ящурка Пржевальского тувинская | | 3 | Eremias przewalskii tuvensis |
| Viperidae (Гадюковые) |
| 41 | Vipera berus | Обыкновенная гадюка | | 3 | Vipera berus |
Все ООПТ
