| Cephalaspidomorphi (Миноги) |
| Petromyzontiformes (Миногообразные) |
| Petromyzontidae (Миноговые) |
| 1 | Lethenteron camtschaticum | Тихоокеанская минога | | 0 | Lethenteron camtschaticum |
| 2 | Lethenteron kessleri | Сибирская минога | | 3 | Lethenteron kessleri |
| Actinopterygii (Костистые рыбы) |
| Acipenseriformes (Осетрообразные) |
| Acipenseridae (Осетровые) |
| 3 | Acipensor baerii | Сибирский осетр | | 1 | Acipenser baerii |
| 4 | Acipensor ruthenus | Стерлядь | | 1 | Acipenser ruthenus |
| Salmoniformes (Лососеобразные) |
| Salmonidae (Лососевые) |
| 5 | Stenodus leucichthyc nelma | Нельма | | 1 | Stenodus leucichthys |
| 6 | Branchiymystax tumensis | Тупорылый ленок или ускуч | | 1 | Brachymystax tumensis |
| Amphibia (Амфибии) |
| Anura (Бесхвостые) |
| Bufonidae (Жабы) |
| 1 | Bufo viridis | Зеленая жаба | | 3 | Bufo viridis |
| Aves (Птицы) |
| Anseriformes (Гусеобразные) |
| Anatidae (Утиные) |
| 11 | Rufibrenta ruficollis | Краснозобая казарка | | 3 | Branta ruficollis |
| 12 | Eulabeia indica | Горный гусь | | 1 | Anser indicus |
| 13 | Anser fabalis | Гуменник | | 3 | Anser fabalis |
| 14 | Cygnopsis cygnoides | Сухонос | | 0 | Anser cygnoides |
| 15 | Cygnus cygnus | Лебедь-кликун | | 3 | Cygnus cygnus |
| 16 | Aythya nyroca | Белоглазая чернеть | | 2 | Aythya nyroca |
| 17 | Anas formosa | Клоктун | | 2 | Anas formosa |
| 18 | Melanitta deglandi | Горбоносый турпан | | 5 | Melanitta deglandi |
| 19 | Mergus albellus | Луток | | 4 | Mergellus albellus |
| 20 | Mergus serrator | Длинноносый крохаль | | 3 | Mergus serrator |
| Apodiformes (Стрижеобразные) |
| Apodidae (Стрижи) |
| 66 | Hirundapus caudacutus | Иглохвостый стриж | | 4 | Hirundapus caudacutus |
| Charadriiformes (Ржанкообразные) |
| Haematopodidae (Кулики-сороки) |
| 49 | Haematopus ostralegus | Кулик-сорока | | 3 | Haematopus ostralegus |
| Glareolidae (Тиркушковые) |
| 55 | Glareola nordmanni | Степная тиркушка | | 2 | Glareola nordmanni |
| Laridae (Чайковые) |
| 56 | Larus ichthyaetus | Черноголовый хохотун | | 3 | Ichthyaetus ichthyaetus |
| 57 | Larus minutus | Малая чайка | | 5 | Hydrocoloeus minutus |
| 58 | Hydroprigne caspia | Чеграва | | 3 | Hydroprogne caspia |
| Burhinidae (Авдотковые) |
| 46 | Burhinus oedicnemus | Авдотка | | 1 | Burhinus oedicnemus |
| Charadriidae (Ржанковые) |
| 47 | Charadrius leschenaultia | Толстоклювый зуек | | 2 | Charadrius leschenaultii |
| Recurvirostridae (Шилоклювковые) |
| 48 | Recurvirostra avosetta | Шилоклювка | | 3 | Recurvirostra avosetta |
| Scolopacidae (Бекасовые) |
| 50 | Philomachus pugnax | Турухтан | | 4 | Philomachus pugnax |
| 51 | Gallinago media | Дупель | | 3 | Gallinago media |
| 52 | Gallinago solitaria | Горный дупель (бекас-отшельник) | | 5 | Gallinago solitaria |
| 53 | Numenius arquata | Большой кроншнеп | | 3 | Numenius arquata |
| 54 | Limosa limosa | Большой веретенник | | 3 | Limosa limosa |
| Ciconiiformes (Аистообразные) |
| Ciconiidae (Аистовые) |
| 9 | Ciconia nigra | Черный аист | | 3 | Ciconia nigra |
| Ardeidae (Цаплевые) |
| 6 | Botaurus stellaris | Большая выпь | | 3 | Botaurus stellaris |
| 7 | Ardea cinerea | Серая цапля | | 3 | Ardea cinerea |
| Threskiornithidae (Ибисовые) |
| 8 | Platalea leucorodia | Колпица | | 2 | Platalea leucorodia |
| Falconiformes (Соколообразные) |
| Accipitridae (Ястребиные) |
| 21 | Pandion haliaetus | Скопа | | 3 | Pandion haliaetus |
| 22 | Circus macrourus | Степной лунь | | 2 | Circus macrourus |
| 23 | Pernus ptilorhynchus | Хохлатый осоед | | 3 | Pernis ptilorhynchus |
| 24 | Buteo hemilasius | Мохноногий курганник | | 3 | Buteo hemilasius |
| 25 | Hieraaetus pennatus | Орел-карлик | | 1 | Hieraaetus pennatus |
| 26 | Aquila rapax | Степной орел | | 3 | Aquila rapax |
| 27 | Aquila clanga | Большой подорлик | | 2 | Aquila clanga |
| 28 | Aquila heliaca | Могильник | | 2 | Aquila heliaca |
| 29 | Aqula chrisaetos | Беркут | | 2 | Aquila chrysaetos |
| 30 | Haliaeetus leucoryphus | Орлан долгохвост | | 1 | Haliaeetus leucoryphus |
| 31 | Haliaeetus albicilla | Орлан белохвост | | 1 | Haliaeetus albicilla |
| 32 | Gypaetus barbatus | Бородач | | 1 | Gypaetus barbatus |
| 33 | Aegypius monachus | Черный гриф | | 3 | Aegypius monachus |
| 34 | Gyps fulvus | Белоголовый сип | | 3 | Gyps fulvus |
| Falconidae (Соколиные) |
| 35 | Falco cherrug | Балобан | | 1 | Falco cherrug |
| 36 | Falco rusticolus | Кречет | | 2 | Falco rusticolus |
| 37 | Falco peregrinus | Сапсан | | 1 | Falco peregrinus |
| 38 | Falco naumanni | Степная пустельга | | 1 | Falco naumanni |
| Galliformes (Курообразные) |
| Phasianidae (Фазановые) |
| 39 | Tetraogallus altaicus | Алтайский улар | | 3 | Tetraogallus altaicus |
| 40 | Alectoris kakelik | Кеклик | | 3 | Alectoris kakelik |
| Gaviiformes (Гагарообразные) |
| Gaviidae (Гагаровые) |
| 1 | Gavia arctica | Чернозобая гагара | | 3 | Gavia arctica |
| Gruiformes (Журавлеобразные) |
| Gruidae (Журавлиные) |
| 41 | Grus grus | Серый журавль | | 2 | Grus grus |
| 42 | Grus monacha | Черный журавль | | 3 | Grus monacha |
| 43 | Anthropoides virgo | Красавка | | 5 | Anthropoides virgo |
| Otididae (Дрофиные) |
| 44 | Otus tarda | Дрофа | | 1 | Otis tarda |
| 45 | Chlamidotis undulate | Джек | | 1 | Chlamydotis undulata |
| Passeriformes (Воробьинообразные) |
| Remizidae (Ремезовые) |
| 70 | Remiz pendulinus | Обыкновенный ремез | | 3 | Remiz pendulinus |
| Alaudidae (Жаворонковые) |
| 67 | Melanocorypha mongolica | Монгольский жаворонок | | 2 | Melanocorypha mongolica |
| Emberizidae (Овсянковые) |
| 73 | Emberiza buchanani | каменная овсянка | | 5 | Emberiza buchanani |
| Fringillidae (Вьюрковые) |
| 74 | Leucosticte brandti | Вьюрок жемчужный | | 5 | Leucosticte brandti |
| 75 | Bucanetes mongolicus | Монгольский снегирь | | 3 | Eremopsaltria mongolica |
| 76 | Carpodacus rubicilla | Большая чечевица | | 3 | Carpodacus rubicilla |
| Laniidae (Сорокопутовые) |
| 68 | Lanius excubitor | Серый сорокопут | | 5 | Lanius excubitor |
| Muscicapidae (Мухоловковые) |
| 69 | Saxicola insignis | Большой чекан | | 1 | Saxicola insignis |
| Paridae (Синицевые) |
| 71 | Parus cyanus | Белая лазоревка | | 5 | Cyanistes cyanus |
| Sittidae (Поползневые) |
| 72 | Tichodroma muraria | Краснокрылый стенолаз | | 4 | Tichodroma muraria |
| Sturnidae (Скворцовые) |
| 77 | Sturnus roseus | Розовый скворец | | 5 | Sturnus roseus |
| Pelecaniformes (Пеликанообразные) |
| Pelecanidae (Пеликановые) |
| 3 | Pelecanus crispus | Кудрявый пеликан | | 1 | Pelecanus crispus |
| 4 | Pelecanus onocrotalus | Розовый пеликан | | 2 | Pelecanus onocrotalus |
| Phalacrocoracidae (Баклановые) |
| 5 | Phalacrocorax carbo | Большой баклан | | 3 | Phalacrocorax carbo |
| Phoenicopteriformes (Фламингообразные) |
| Phoenicopteridae (Фламинговые) |
| 10 | Phoenicopterus rosens | Фламинго | | 3 | Phoenicopterus roseus |
| Podicipediformes (Поганкообразные) |
| Podicipedidae (Поганковые) |
| 2 | Podiceps nigricollis | Черношейная поганка | | 3 | Podiceps nigricollis |
| Strigiformes (Совообразные) |
| Strigidae (Настоящие совы) |
| 61 | Bubo bubo | Филин | | 2 | Bubo bubo |
| 62 | Nyctea scandiaca | Белая сова | | 3 | Bubo scandiacus |
| 63 | Surnia ulula | Ястребиная сова | | 4 | Surnia ulula |
| 64 | Glaucidium passerinum | Воробьиный сыч (сычик) | | 4 | Glaucidium passerinum |
| 65 | Strix nebulosa | Бородатая неясыть | | 4 | Strix nebulosa |
| Pteroclidiformes (Рябковые) |
| Pteroclididae (Рябковые) |
| 60 | Syrraptes paradoxus | Саджа | | 3 | Syrrhaptes paradoxus |
| Columbiformes (Голубеобразные) |
| Columbidae (Голубиные) |
| 59 | Columba polumbus | Вяхирь | | 4 | Columba palumbus |
| Mammalia (Млекопитающие) |
| Artiodactyla (Парнопалые) |
| Bovidae |
| 19 | Gasella gutturosa | Дзерен | | 1 | Procapra gutturosa |
| 20 | Ovis ammon ammon | Алтайский горный баран | | 1 | Ovis ammon ammon |
| Cervidae (Оленьи) |
| 18 | Rangifer tarandus angustifrons | Олень северный лесной сибирский | | 2 | Rangifer tarandus angustifrons |
| Carnivora (Хищные) |
| Canidae (Псовые) |
| 12 | Cuon alpinus | Красный волк | | 0 | Cuon alpinus |
| Felidae (Кошачьи) |
| 16 | Uncia uncial | Снежный барс | | 1 | Uncia uncia |
| 17 | Felis manul | Манул, палласов кот | | 2 | Felis manul |
| Mustelidae (Куньи) |
| 14 | Varies foina | Каменная куница | | 3 | Martes foina |
| 15 | Lutra lutra | Речная выдра | | 3 | Lutra lutra |
| Ursidae (Медвежьи) |
| 13 | Ursus arctos | Бурый медведь | Сайлюгемская популяция | 2 | Ursus arctos |
| Chiroptera (Рукокрылые) |
| Vespertilionidae (Гладконосые (обыкновенные) летучие мыши) |
| 1 | Myotis mystacinus | Ночница усатая | | 4 | Myotis mystacinus |
| 2 | Myotis brandti | Ночница Брандта | | 4 | Myotis brandtii |
| 3 | Myotis iconnicjvi | Ночница Иконникова | | 4 | Myotis ikonnikovi |
| 4 | Myotis frater | Ночница длиннохвостая | | 4 | Myotis frater |
| 5 | Myotis dasycneme | Ночница прудовая | | 4 | Myotis dasycneme |
| 6 | Myotis daubentoni | Водяная ночница | | 4 | Myotis daubentonii |
| 7 | Plecotus auritus | Бурый ушан | | 4 | Plecotus auritus |
| 8 | Nyctalus noctula | Вечерница рыжая | | 4 | Nyctalus noctula |
| 9 | Vespertilio nilssoni | Северный кожанок | Устьканская популяция | 4 | Eptesicus nilssonii |
| 10 | Murina leucogaster | Трубконос сибирский | | 4 | Murina leucogaster |
| Rodentia (Грызуны) |
| Dipodidae (Тушканчиковые) |
| 11 | Allactaga sibirica | Тушканчик-прыгун | | 5 | Allactaga sibirica |
| Reptilia (Рептилии) |
| Squamata (Чешуйчатые) |
| Viperidae (Гадюковые) |
| 1 | Vipera ursini | Степная гадюка | | 3 | Vipera ursinii |
Все ООПТ
